Relation of chronic atrophic gastritis and intestinal metaplasia with Helicobacter pylori and tumor necrosis factor-α and macrophage migration inhibitory factor polymorphisms in a population of Easten Anatolia

INTRODUCTION: We aimed to determine the effects of tumour-necrosis factor-α (TNF-α) and macrophage migration inhibitory factor (MIF) gene polymorphisms, Helicobacter pylori (H. pylori) infection, on the risk of developing chronic atrophic gastritis (CAG) and intestinal metaplasia (IM).
METHODS: The TNF-α-308G/A and MIF-173G/C single nucleotide polymorphisms (SNPs) were genotyped using polymerase-chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) analysis, in 84 patients (43 CAG and 41 IM) and 40 healthy controls in a region of Eastern Anatolia.
RESULTS: An increased risk of CAG was found in subjects with TNF-α-308 GA genotype, negative for H. pylori infection or TNF-α-308 AA genotype carriers and negative for H. pylori infection. An elevated risk of IM was found in subjects with TNF-α-308 GA genotype and negative for H. pylori infection or TNF-α-308 AA genotype and negative for H. pylori infection. An increased risk of CAG was found in subjects with TNF-α-308GA genotype, and positive for H. pylori infection. An increased risk of CAG was found in subjects with MIF-173GC genotype and negative for H. pylori infection or MIF-173CC genotype carriers and negative for H. pylori infection. An elevated risk of IM was found in subjects with MIF-173GC genotype and negative for H. pylori infection. An elevated risk of IM was found in subjects with MIF-173GC genotype and positive for H. pylori infection.
DISCUSSION AND CONCLUSION: Therefore, the TNF-α-308G/A and MIF-173G/C genotyping may be used as biomarkers at the early stage of the gastric cancer.

Keywords: Chronic atrophic gastritis, Intestinal metaplasia, gene polymorphisms, tumor necrosis factor- α, macrophage migration inhibitory factor, Helicobacter pylori

Türkiye’de bir doğu populasyonunda kronik atrofik gastrit ve intestinal metaplazi ile tümör nekrozis faktör-α ve makrofaj migrasyon inhibitör faktör gen polimorfizmleri ve Helikobakteri pilorinin ilişkisi

GİRİŞ ve AMAÇ: Kronik atrofik gastrit (KAG) ve intestinal metaplazi (İM) gelişme riskinde tümör nekrozis faktör-α (TNF-α), makrofaj migrasyon inhibitör faktör (MIF) gen polimorfizmleri ve Helikobakteri pilori (H. pilori)’nin etkisini tespit etmek amaçlandı.
YÖNTEM ve GEREÇLER: TNF-α-308G/A ve MIF-173G/C tek nükleotid polimorfizmi Türkiyenin doğusunda bir bölgede 84 hastada (43 KAG ve 41 IM) ve 40 sağlıklı kontrolde polimeraz zincir reaksiyon-restriksiyon fragman uzunluk polimorfizim (PZR-RRUP) analizi kullanılarak genotiplendirildi.
BULGULAR: H. pilori infeksiyonu negatif ve TNF-α-308G/A genotipli olgularda ya da H. pilori infeksiyonu negatif ve TNF-α-308 AA taşıyıcı olgularda KAG riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu negatif ve TNF-α-308G/A genotipli olgularda yada H. pilori infeksiyonu negatif ve TNF-α-308AA taşıyıcı olgularda IM riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu pozitif ve TNF-α-308G/A genotipli olgularda KAG riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu negatif ve MIF-173GC genotipli olgularda ya da H. pilori infeksiyonu negatif ve MIF-173CC taşıyıcı olgularda KAG riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu negatif ve MIF-173GC genotipli olgularda IM riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu pozitif ve MIF-173GC genotipli olgularda IM riskinde bir artış bulundu.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Böylece, TNF-α-308G/A ve MIF-173G/C genotipleri erken evre gastrik kanserde biyomarkır olarak kullanılabilir.

Anahtar Kelimeler: Kronik atrofik gastrit, intestinal metaplazi, gen polimorfizmleri, tümör nekrozis faktör-α, makrofaj migrasyon inhibitör faktör, Helikobakter pilori