Relation of chronic atrophic gastritis and intestinal metaplasia with Helicobacter pylori and tumor necrosis factor-α and macrophage migration inhibitory factor polymorphisms in a population of Easten AnatoliaAli Karaman1, Hatip Aydın1, Bilge Geçkinli1, Doğan Nasır Binici2, İbrahim Pirim31İstanbul Zeynep Kamil Women and Children Training and Research Hospital, Department of Medical Genetics, Istanbul
2Erzurum Training and Research Hospital, Gastroenterology Division, Department of Intenal Medicine, Erzurum
3İzmir Katip Celebi University Medical School, Department of Medical Biology
INTRODUCTION: We aimed to determine the effects of tumour-necrosis factor-α (TNF-α) and macrophage migration inhibitory factor (MIF) gene polymorphisms, Helicobacter pylori (H. pylori) infection, on the risk of developing chronic atrophic gastritis (CAG) and intestinal metaplasia (IM).
METHODS: The TNF-α-308G/A and MIF-173G/C single nucleotide polymorphisms (SNPs) were genotyped using polymerase-chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) analysis, in 84 patients (43 CAG and 41 IM) and 40 healthy controls in a region of Eastern Anatolia.
RESULTS: An increased risk of CAG was found in subjects with TNF-α-308 GA genotype, negative for H. pylori infection or TNF-α-308 AA genotype carriers and negative for H. pylori infection. An elevated risk of IM was found in subjects with TNF-α-308 GA genotype and negative for H. pylori infection or TNF-α-308 AA genotype and negative for H. pylori infection. An increased risk of CAG was found in subjects with TNF-α-308GA genotype, and positive for H. pylori infection. An increased risk of CAG was found in subjects with MIF-173GC genotype and negative for H. pylori infection or MIF-173CC genotype carriers and negative for H. pylori infection. An elevated risk of IM was found in subjects with MIF-173GC genotype and negative for H. pylori infection. An elevated risk of IM was found in subjects with MIF-173GC genotype and positive for H. pylori infection.
DISCUSSION AND CONCLUSION: Therefore, the TNF-α-308G/A and MIF-173G/C genotyping may be used as biomarkers at the early stage of the gastric cancer.
Keywords: Chronic atrophic gastritis, Intestinal metaplasia, gene polymorphisms, tumor necrosis factor- α, macrophage migration inhibitory factor, Helicobacter pylori
Türkiye’de bir doğu populasyonunda kronik atrofik gastrit ve intestinal metaplazi ile tümör nekrozis faktör-α ve makrofaj migrasyon inhibitör faktör gen polimorfizmleri ve Helikobakteri pilorinin ilişkisiAli Karaman1, Hatip Aydın1, Bilge Geçkinli1, Doğan Nasır Binici2, İbrahim Pirim31İstanbul Zeynep Kamil Kadın ve Çocuk Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Genetik Bölümü, İstanbul
2Erzurum Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Gastroenteroloji Bölümü, Intenal Tıp Anabilim Dalı, Erzurum
3İzmir Katip Çelebi Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, İzmir
GİRİŞ ve AMAÇ: Kronik atrofik gastrit (KAG) ve intestinal metaplazi (İM) gelişme riskinde tümör nekrozis faktör-α (TNF-α), makrofaj migrasyon inhibitör faktör (MIF) gen polimorfizmleri ve Helikobakteri pilori (H. pilori)’nin etkisini tespit etmek amaçlandı.
YÖNTEM ve GEREÇLER: TNF-α-308G/A ve MIF-173G/C tek nükleotid polimorfizmi Türkiyenin doğusunda bir bölgede 84 hastada (43 KAG ve 41 IM) ve 40 sağlıklı kontrolde polimeraz zincir reaksiyon-restriksiyon fragman uzunluk polimorfizim (PZR-RRUP) analizi kullanılarak genotiplendirildi.
BULGULAR: H. pilori infeksiyonu negatif ve TNF-α-308G/A genotipli olgularda ya da H. pilori infeksiyonu negatif ve TNF-α-308 AA taşıyıcı olgularda KAG riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu negatif ve TNF-α-308G/A genotipli olgularda yada H. pilori infeksiyonu negatif ve TNF-α-308AA taşıyıcı olgularda IM riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu pozitif ve TNF-α-308G/A genotipli olgularda KAG riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu negatif ve MIF-173GC genotipli olgularda ya da H. pilori infeksiyonu negatif ve MIF-173CC taşıyıcı olgularda KAG riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu negatif ve MIF-173GC genotipli olgularda IM riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu pozitif ve MIF-173GC genotipli olgularda IM riskinde bir artış bulundu.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Böylece, TNF-α-308G/A ve MIF-173G/C genotipleri erken evre gastrik kanserde biyomarkır olarak kullanılabilir.
Anahtar Kelimeler: Kronik atrofik gastrit, intestinal metaplazi, gen polimorfizmleri, tümör nekrozis faktör-α, makrofaj migrasyon inhibitör faktör, Helikobakter pilori
Ali Karaman, Hatip Aydın, Bilge Geçkinli, Doğan Nasır Binici, İbrahim Pirim. Relation of chronic atrophic gastritis and intestinal metaplasia with Helicobacter pylori and tumor necrosis factor-α and macrophage migration inhibitory factor polymorphisms in a population of Easten Anatolia. Medeniyet Med J. 2014; 29(1): 12-19
Corresponding Author: Ali Karaman, Türkiye |
|