Determination of HLA Tissue Type According to the Etiology of Patients with Chronic Renal FailureBurcu KARAKUS TURAN1, Fahri UCAR1, Vural Taner YILMAZ2, Yahya KILINC1, Sule DARBAŞ ARAS1, Huseyin KOCAK2, Nurten SAYIN EKINCI1, Bulent AYDINLI3, Habibe Sema ARSLAN11Akdeniz University School of Medicine, Departmant of Medical Biology and Genetics, Antalya, Turkey
2Akdeniz University Faculty of Medicine, Depertmant of Internal Medicine, Division of Nephrelogy Antalya, Turkey
3Akdeniz University Faculty of Medicine, Depertmant of General Surgery, Antalya, Turkey
Objective: Chronic kidney disease (CKD) is a prominent public health concern, is defined as functional and structural damage to the kidneys. This study aims to investigate the association between human leukocyte antigen (HLA) alleles individuals with CKD and the different etiological subgroups of diesease.
Methods: Genomic DNA was obtained from peripheral blood samples of 1,079 patients with retrospective CKD and 1,111 healthy control individuals. HLA genotyping was conducted using the Luminex based low-resolution method. Allele frequency distributions were calculated with the help of Arlequin v3.11 population genetics statistics program and SPSS v23.0 program, and p<0.05 values were accepted as significant by chi-square tests.
Results: HLA A*02 (21.83%), B*35 (18.30%), DRB1*11 (21.41%) alleles were observed most frequently in individuals with CKD, respectively. The prevalance of the HLA A*02 allele (p<0.001) was significantly greater relative to the control group. In our study, B*08, B*49, B*50 alleles in the HLA B locus (p=0.002, p=0.012 p=0.009) and DRB1*03, *04 alleles in the HLA DRB1 locus (p<0.001, p<0.001) were found positively associated with CKD. A*02, A*11, A*74 alleles at the HLA A locus (p=0.003, p<0.001, p=0.009) and B*27, B*39, B* alleles at the HLA B locus 40, B*59 (p<0.001, p<0.001, p<0.001, p=0.009), DRB1*07, *08, *09, *13, *16 (p<0.001, p=0.012, p=0.007, p<0.001, p<0.001) alleles were determined as negatively associated with the disease. Among the etiological groups of CKD, cystic kidney disease (36.8%), hypertension (16.8%) and urological anomalies (16.6%) were negatively associated with the HLA-DR*13 allele.
Conclusions: Since CKD shows serious morbidity and mortality, this comprehensive study of HLA subgroups gave an explanatory idea about which alleles associated with the disease in terms of susceptibility and protection. Keywords: Chronic Renal Insufficiency, DNA Probları, HLA, polymerase chain reaction-SSOP
Kronik Böbrek Yetmezliği Hastalarının Etiyolojilerine Göre HLA Doku Tipinin BelirlenmesiBurcu KARAKUS TURAN1, Fahri UCAR1, Vural Taner YILMAZ2, Yahya KILINC1, Sule DARBAŞ ARAS1, Huseyin KOCAK2, Nurten SAYIN EKINCI1, Bulent AYDINLI3, Habibe Sema ARSLAN11Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı, Antalya, Türkiye
2Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi, İç Hastalıkları Anabilim Dalı, Nefroloji Anabilim Dalı Antalya, Türkiye
3Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Genel Cerrahi Anabilim Dalı, Antalya, Türkiye
Amaç: Kronik böbrek hastalığı (KBH) belirgin bir halk sağlığı sorunu olup fonksiyonel ve yapısal böbrek hasarı ile tanımlanmaktadır. Bu çalışma, KBH olan bireylerde insan lökosit antijeni (HLA) allel dağılımının, hastalığın farklı etiyolojik alt gruplarıyla olan ilişkisini araştırmayı amaçlamaktadır.
Yöntemler: Retrospektif olarak incelenen, KBH tanılı 1079 hasta ve 1111 kontrol grubundan alınan periferik kan numunelerinden elde edilen DNA’lar, HLA tiplemesi için düşük çözünürlüklü Luminex yöntemi kullanılarak analiz edilmiştir. Allel frekans dağılımları, Arlequin v3.11 popülasyon genetiği istatistik programı ve SPSS v23.0 yazılımı ile hesaplanmış; p<0,05 olan değerler ki-kare testleri ile anlamlı kabul edilmiştir.
Bulgular: KBH’li bireylerde sırasıyla en yaygın HLA A*02 (%21,83), B*35 (%18,30), DRB1*11 (%21,41) alelleri gözlenmiştir. HLA A*02 (p<0,001) alel frekansı kontrol grubuyla kıyaslandığında istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur. Araştırmamızda, HLA B lokusunda B*08, B*49, B*50 (p=0,002, p=0,012, p=0,009) ve HLA DRB1 lokusunda DRB1*03, DRB1*04 (p<0,001, p<0,001) alelleri KBH ile pozitif ilişkili bulunmuşken, HLA A lokusunda A*02, A*11, A*74 (p=0,003, p<0,001, p=0,009) ve HLA B lokusunda B*27, B*39, B*40, B*59 (p<0,001, p<0,001, p<0,001, p=0,009) alelleri ve HLA DRB1 lokusunda DRB1*07, *08, *09, *13, *16 (p<0,001, p=0,012, p=0,007, p<0,001, p<0,001) alelleri ise hastalıkla negatif ilişkili olarak bulunmuştur.
Sonuçlar: KBH’ın ciddi sağlık sorunlarına ve ölüme yol açması nedeniyle, bu çalışmada hastalığa yatkınlık oluşturan ve hastalıktan koruyucu HLA alt grupları belirlenmiştir. Anahtar Kelimeler: Kronik Böbrek yetmezliği, DNA propları, HLA, polimeraz zincir reaksiyonu-SSOP
Corresponding Author: Yahya KILINC, Türkiye
|
|